外装は、国指定重要文化財となっている江戸時代の商家と「こみせ」をイメージした建築になっています。
館内の1階部分は見学無料となっており、売店やこけし工人によるこけし作りの実演コーナー、体験学習室、日本一大きい4m21cmのジャンボこけし、開館15周年記念事業で制作した木地だるま等があります。
2階有料部分には津軽系をはじめ、全国のこけしと木地玩具約3,000点を展示し、故盛秀太郎・佐藤善両氏のコーナーなどもあります。